次世代高通量定序核心實驗室( NGS Core )主要任務包括：
(一) 協助校內各研究單位及系統生物學中心各項高通量定序相關研究；
(二) 開發並精進各類高通量定序服務平台，以即時支援先鋒型研究；及
(三) 提供各項高通量定序技術實驗設計與操作及資料分析之諮詢與教學。
自100年度至今，本核心實驗室服務已提供次世代定序服務將近五年，所服務單位遍及校內生命科學院、生物資源暨農學院及醫學院各單位。目前服務的定序主力機型為 Illumina MiSeq，自 101 年 7 月起服務至今，頁已累計上機達 63 次，共計服務 58 個研究專案。
NGS Core目前已開發 small RNA、RNA-Seq、RIP-Seq、ChIP-Seq、small genome、PCR amplicon、16S rRNA metagenomics、piRNA (piRNA enrichment) 及小量捕獲性重定序 (capture based resequencing) 等多樣化定序服務，同時並優化新開發的 GBS (genotyping by sequencing) 及極微量 ChIP-DNA 等建庫服務，以支援校內多種研究類型，並提供高品質的定序服務。